когда начинается и когда заканчивается осенью, отзывы и советы грибников
Грибной сезон в Ленинградской области в 2023 году традиционно продлится около полугода: с середины апреля и до конца ноября. Местные леса богаты на дары природы. Здесь можно встретить больше сотни съедобных видов.
В Ленинградской области растет множество видов съедобных грибов.Фото: Олег РУКАВИЦЫН
Как рассказывает член Санкт-Петербургского микологического общества, организатор экскурсий по грибным местам Антон Трофимов, начало и конец грибного сезона — понятия весьма условные, все зависит от погоды.
— Начало сезона напрямую связано со скоростью таяния снега. Первые весенние грибы очень зависимы от влажности почвы, поэтому примерное начало роста — середина апреля. Конец сезона зависит от начала заморозков, но даже после них некоторые виды грибов продолжают расти, — говорит Трофимов.
Урожайными местами опытные грибники, конечно, делятся неохотно. Новичкам они советуют не опираться на популярные координаты из соцсетей: скорее всего вы наткнетесь на уже опустевшие опушки.
Расскажем, чем порадует грибной сезон в Ленинградской области в 2023 году.
Когда начинается грибной сезон в Ленинградской области
В середине апреля начинают сезон, в основном, только опытные грибники. Чтобы найти самые ранние виды, придется запастись терпением и немало побродить по лесу. А вот массовый период сбора, когда за грибами идут и новички, обычно начинается в конце июля. «Охотятся» на популярные белые, подберезовики, подосиновики, лисички.
В конце июля в лесах появляются белые грибы, подберезовики, подосиновики, лисички.Фото: Анатолий ЖДАНОВ
Пик грибного изобилия наступает в августе и продолжается в сентябре и октябре. Поэтому конец лета и начало осени — самое активное время у грибников. Если год выдался урожайный, то не придется искать особые координаты: с пустой корзинкой из леса не уйдете.
Узнать подробнее
Какие есть ранние грибы весной
Грибной сезон в Ленинградской области по традиции начинается с представителей сморчковых. Грибы с «морщинистой» шляпкой появляются уже в середине апреля.
Найти их можно в хвойных и смешанных лесах. Первые весенние грибы ежегодно находят в Выборгском, Приозерском, Кингисеппском, Лужском и других районах.
Фото: Наталия СИДОРОВА
Еще один ранний гриб в регионе — строчок гигантский. Его можно найти с конца апреля по конец мая в хвойных и лиственных лесах, обычно они растут неподалеку от березовых пней.
Когда заканчивается грибной сезон в Ленинградской области
Вешенку позднюю можно встретить и в декабре.Фото: commons.wikimedia.org
Обычно грибной сезон жители Ленинградской области массово завершают к концу октября. Среди поздних видов самый популярный в регионе — лисичка трубчатая. Уже после первых заморозков грибные полянки пустеют. Однако, как отмечают опытные грибники, продолжать ходить в лес можно и в ноябре и даже в декабре. В это время можно встретить морозоустойчивые виды грибов — вешенку позднюю или фламмулину.
Как определить гриб по фото
Некоторые боятся и не любят собирать грибы, опасаясь принести домой что-нибудь ядовитое и несъедобное.
И правильно делают! Но в онлайн-эпоху можно легко распознать гриб по фото. Главное – знать, где смотреть. Оказывается, существует несколько приложений для смартфонов, которые за считанные секунды помогут вам идентифицировать находку. Мы собрали для вас самые лучшие сайты и приложения на «грибную» тему.
Узнать подробнее
Популярные вопросы и ответы
Какие грибные места в Ленинградской области самые популярные?
Петербуржцы чаще всего едут в районы Ленинградской области поближе к городу, — Приозерский, Выборгский, Всеволожский, Ломоносовский, Гатчинский. Именно они считаются самыми популярными. Заядлые грибники часто не жалеют времени и отправляются в районы подальше — например, Тихвинский, Лужский или Лодейнопольский.
Каких грибов в Ленинградской области больше всего?
В регионе можно найти самые популярные виды — белые, подосиновики, подберезовики, лисички, моховики, маслята, грузди, опята. Именно они встречаются в большом количестве в разгар сезона.
Как отличить съедобные грибы от ядовитых?
Перед походом в лес новичку стоит поработать над теорией — изучить внешний вид и отличительные особенности популярных съедобных грибов, рассмотреть их фото и иллюстрации.
Начинать «тихую охоту» лучше всегда с опытным грибником, который поможет разобраться на месте. Всегда стоит помнить главное правило грибников: если не знаешь, что за гриб, — не бери его.
Как добраться
Выборг
Электричка
Из Санкт-Петербурга, с Выборгского вокзала — через Зеленогорск, Рощино. Время в пути 1 час 15 минут.
Машина
Из Санкт-Петербурга 132 км по трассе «Скандинавия».
Царское Село, Павловск, Вырицы
Электричка
Из Санкт-Петербурга, с Витебского вокзала.
Павловск, Петергоф, Пушкин
Маршрутное такси
Ходят по данным направлениям от станции метро «Московская».
Гатчина
Машина
Из Санкт-Петербурга 45 км по Киевскому шоссе.
Копорье
Машина
Из Санкт-Петербурга 105 км по Таллинскому шоссе.
Теплоход
Из Санкт-Петербурга в Выборг, Петергоф, Кронштадт ходят речные трамвайчики и «Ракеты». Есть круизы по рекам и озерам со стоянками в Старой Ладоге, на Валааме и других интересных местах.
Найдите билеты по выгодным ценам на 2023 год
Видеоотчеты о рыбалке. Страница 123
Рубрики
- Все видео
18035
- Видео моего региона
432
- На рыбалке
5275
- Видеоотчеты о рыбалке
4413
- Разное
3242
- Обзоры снастей
1511
- Искусство рыбалки
933
- Зимняя рыбалка — видео
- Подводные съемки
764
- Техника для рыбалки
700
- Приготовление рыбы
209
Новые комментарии
Самое популярное
- В погоне за мордатой щукой 129 Видеоотчеты о рыбалке
- Успеть до половодья .
Щука весной на джиг.
87
На рыбалке - ПРЕМЬЕРА ПЕСНИ на рыбалке, на Оби гармонь 85 Разное
- Рыбалка на спаде воды 77 Видеоотчеты о рыбалке
- Щука атакует! 66 Подводные съемки
- на живца 65 На рыбалке
- В погоне за мечтой. Ловля трофейного тайменя на Плато Путорана
65
На рыбалке
- Весенняя ловля ЩУКИ в зарослях 60 Видеоотчеты о рыбалке
- Один день на реке 60 Видеоотчеты о рыбалке
- Рыбалка на Тайване 58 На рыбалке
Щука весной на джиг.
87
На рыбалке
Ловля трофейного тайменя на Плато Путорана
65
На рыбалкеРыбалка со льда.
Брод. Ловля монстриков — ротанов на сало Видеоотчеты о рыбалкеРыбачим на джиг в мороз, ловля щуки в Ноябре
Видеоотчеты о рыбалкеРыбалка на спиннинг в мороз еще то удовольствие, но когда происходит поклевка забываешь про мороз сразу. Рыбалка была удачной, жор щуки был, но не того размера, все же достойную щуку я поймал.
Щука 5.2 кг. на Jackall Magallon .Китайский воблер на щуку с AliExpress .
Видеоотчеты о рыбалкеJackall Magallon http://ali.ski/ip_Fe
Rapala X-Rap http://ali.ski/S1dNU4 ( точная копия )
Липгрип http://ali.ski/1CHIfA Качество на 5, очень удобно !
Коробка http://ali.
ski/b29Jfv под воблеры лучше не придумаешь.
————————————
————————————
Приглашаю Вас в интересную группу вКонтакте, рыболовные товары с Aliexpress : https://vk.com/club116984321 Здесь Вы найдете обзоры приманок, снастей, отчеты с рыбалок и многое другое!
——————————————————————————————————
Не забудь подписаться на мой канал Рыбалка в России http://www.youtube.com/channel/UC5bsm…
————————————————————————————————
Китайский воблер, копия Jackall Magallon
Минноу, Slow Sinking.
На 0.16 шнуре летит 25-35 метров, погружается на 0.1-0.5 м
Размер: 113 мм
Вес: 13 г
Заглубление: 0,1-0,5 м
JACKALL MAGALLON — это воблер который поистине творит чудеса по неактивному хищнику, по той рыбе которую вообще ничем не привлечь.
Воблер JACKALL Magallon очень удачная и оригинальная модель, её игра не похожа на поведение ни одного другого воблера. Даже при небольшой амплитуде рывков спиннингом, он совршает размашистые колебания и кувырки в воде.
Этот воблер, несмотря на его немалую стоимость, можно рекомендовать спиннингисту, только начинающему ловить твичингом, поскольку воблер Шакал Магаллон совсем не требователен к технике анимации.
Он работает и при коротких твичах, его можно проводить небольшими потяжками, можно делать затяжные паузы во время которых чуть- чуть шевелить его. Щука с удовольствием откликается на любую предложенную технику.
Поход на Озеро Тальмень 1 часть. Через перевал Крепкий
Видеоотчеты о рыбалке Фильм, где показана очень хорошая рыбалка на хариуса и подробный пешеходный туристический маршрут к озеру.
В этой первой части фильма рыбалка начнётся в конце видео. А в начале ролика показан старт с нижнего Мультинского озера, подъём по озёрам Крепким, подробный видеоотчёт о прохождении перевала Крепкий, спуск к озеру верхнему Тихому, спуск к озеру нижнему Тихому, рыбалка на озере Тихом
Видео 1 час 26 мин.
Осенняя плотва на фидер. Вкусный обед на рыбалке
Видеоотчеты о рыбалкеЛюбимое осеннее занятие — ловля плотвы на легкий фидер. В этом видео увидите как поймать плотву и леща на легкий фидер. Как всегда вкусный обед приготовленный на природе нас согрел.
Отцеп для воблеров. Рыболовный отцеп используем на практике
Видеоотчеты о рыбалке
Спасение воблра и ратлина на практике .Работа отцепа в реальных условиях.Мороз и безклёвие…
Видеоотчеты о рыбалкеНа рыбалку в ноябре. Душевный отдых!
уже как привычка выезжать на рыбалку! без разницы на время года и погоду! еще и совмещать с охотой и тем более в хорошей компании Поехали на Кокжиде в Алмаатинской области к реке которая изрядно измельчала и исхудала) рыба вроде есть! как всегда кадры с высоты полета dji
Осенние поиски щуки на малом озере. Ищем осенние трофеи.
Видеоотчеты о рыбалкеБыло огромное желать поймать трофейную щуку. Рыбалка осенью всегда подразумевает встречу с трофеем, в нашем случае с трофейной щукой. Водоём известен, щуки крупной в достатке, а вот погода осенняя совсем не радует.
Дождь чередуется с солнцем, ветер задувает. Рыбу свою нашли хоть и пришлось пробиваться через узенькую протоку между 2 частями озера. Вода за лето упала и что бы перебраться надо было изрядно попотеть. Очень хорошо провели время на воде, хоть погода и не радовала, но щука брала и это радовало!
Ловля карпа на макушатник
Видеоотчеты о рыбалкеВ этом видео вы узнаете, как поймать карпа разными способами, одним из них является ловля карпа на бойлы, а также ловля карпа на горох и ловля сазана на кукурузу, узнаете про carp fishing.
Тут будет тактика ловли карпа, узнаете про ловля карпа на фидер и ловля карпа на кукурузу. С помощью моих рекомендаций вы сможете узнать про флэт фидер, а ещё усвоите навыки ловля сазана на горох.
Самое большое удовольствие это ловля карпа на макушатник и ловля сазана на жмых.
Эта уловистая приманка опять выручила.
Фидер + спиннинг осенью. Видеоотчеты о рыбалкеПоехал на реку с целью еще раз в этом году половить на фидер. На фидер увидел всего одну поклевку и поймал рыбу. Хорошо что в этот раз взял с собой спиннинг. Окунь хорошо реагировал на предложенную приманку. В итоге поймал несколько не плохих полосатых кабанчиков.
Осенний спиннинг на лесной речке
Видеоотчеты о рыбалкеЖуткая осень в этом году выдалась, то дождь, то снег, то ветер, но чаще все вместе. Выдался погожий денек — сразу на рыбалку. Прогулялся по осеннему лесу, пошуршал опавшими листьями, кое-что поймал на речке, в общем редкий хороший осенний денек не пропал зря.
В улове: щука и налим
Видеоотчеты о рыбалкеРыбалка перед ледоставом на живца с ночевкой на Большой Реке.
Активность хищника удивила! Сильный ветер мешал реализации, но рыбалка состоялась! На уже задавленного живца хищник покушался снова и снова. И хотя в основном он бросал живца, свою рыбу я поймал. Перед еще большей непогодой успел урвать сутки рыбалки в одного на берегу Большой Реки.
До дома добирался долго, спасибо всем, кто помог в дороге!
Жор щуки в мороз
Видеоотчеты о рыбалкеРыбалка на спиннинг в мороз, кольца стынут, руки не слушаются. Не думал что в этом году у меня еще получиться съездить на рыбалку на «Пруд Дёмина» но желание поймать трофей перебороло меня и как показала рыбалка хорошо что поехал. Первая поклевка была уже в девять утра и щука по весу ловилась по нарастающей. Осенний жор щуки явно на этом водоеме начался, остается только найти, где стоит щука и подобрать для нее приманку. Сезон еще не закрыт и пока вода жидкая будем рыбачить на спиннинг и готовится к зимней рыбалке.
Друзья приятного просмотра.
Чебак клюёт без остановки
Видеоотчеты о рыбалкеПродолжение бесконечного клёва на чебака не заставило себя долго ждать. Пришла маленькая девочка Полина и была в восторге от того, что ей дали вытащить рыбку. 2 серия
Рыбалка с ночевкой, октябрь время трофеев хищника судак сом fisherman 20
Видеоотчеты о рыбалкеРыбалка с ночевкой, октябрь время трофеев хищника судак сом fisherman 20
Чебак клюёт без остановки.1 серия.
Видеоотчеты о рыбалкеЧебак прёт дурнем на прикормку. Ну и мы тут как тут.
Жена поймала щуку на 9 кг
Видеоотчеты о рыбалкеБешеный клёв язей и щук. Последняя рыбалка на спиннинг.
В этот раз река Кеть порадовала своим уловом. Жена поймала свою рекордную щуку в 9кг!
P.S. к сожалению записать этот момент не удалось.
Нашли место с ТРОФЕЙНОЙ краснопёркой
Видеоотчеты о рыбалкеЖирное завершение сезона. Попали на бешеный клёв!
Осенняя поездка за краснопёркой. Решили закрыть сезон по краснопёрке в одной найденной на прошлых рыбалках точке. Красноперки там было достаточно много, попали на бешеный клёв, попадались по нашим меркам и трофейные экземпляры. Эмоции и адреналин были на пике. В каждом месте жирная краснопёрка бешено атаковала на каждом забросе.
Изредка наглые щуки пытались откусить наши мелкие вертушки и у них это получалось.
Твичинг-баттл II. Осенний раунд. Империя наносит ответный удар.
Видеоотчеты о рыбалкеПредставляю вашему вниманию второй, осенний раунд противостояния между двумя крупными приманками от японских компаний Lucky Craft и Megabass.
Щука на воблер
Видеоотчеты о рыбалкеРыбалка в октябре на щуку. Пруд Дёмина находится 120 км от Самара, и хозяева пруда вот уже второй год организовывают соревнование по ловли щуки с лодок. В этом году и я решил принять участие. Рыбалка на щуку и так азартная, а когда еще и соперников много, адреналин зашкаливает. Приехал на водоем восемь утра, на воду вышел около девяти, до обеда не одной поклевки у меня не было.
Рыбаков для участия собралось около двадцати человек, среди участников присутствовали и девушки которые не чуть не уступали мужчинам. Погода в этот день не радовала, ветер был не меньше 8 м.с. и чувствительность приманок была почти на нуле, нитку парусило сильно. Ну а с каким результатом закончил рыбалку я смотрите в видео, приятного просмотра.
Льняной профиль | Центр ресурсов сельскохозяйственного маркетинга
Пересмотрено в феврале 2022 г.
Обзор Лен ( Linum usitatissimum L.) — важная сельскохозяйственная культура во всем мире, которая ценится как пищевая и кормовая добавка, а также благодаря своему маслу и клетчатке. Лен – одна из древнейших возделываемых культур. Он произрастает в регионе, простирающемся от восточного Средиземноморья до Индии, и, вероятно, впервые был одомашнен в Плодородном полумесяце. В настоящее время лен выращивается на площади около 12 миллионов акров по всему миру, причем самые большие площади производства находятся в Казахстане, России, Канаде и Китае.
Лен был впервые завезен в Соединенные Штаты колонистами, прежде всего, для производства волокна для одежды. Позже, когда строительная промышленность в США расширилась, спрос на масло, извлеченное из семян льна, обычно называемое льняным маслом, вырос, поскольку оно было важным компонентом красок. Однако к 1940-м годам хлопок заменил лен в качестве широко используемого волокна, а технические масла, полученные из нефти, частично заменили спрос на льняное масло, и производство льна в США резко упало.
Производство Лен, растение с голубыми цветками, лучше всего растет в прохладном климате с длинным световым днем. Хотя традиционно его выращивали из-за семян и волокна, в настоящее время в Северной Америке его выращивают в основном из-за семян. В 2021 году лен выращивался на 268 000 акров в США с общим объемом производства 2,708 млн бушелей. Средняя урожайность льна составила 10 бушелей с акра по сравнению с 19 бушнями с акра годом ранее из-за засухи в некоторых производственных районах.
Средняя цена на лен в 2020 году составляла 10,30 доллара за бушель (NASS 2021). Большая часть льна в настоящее время выращивается в Северной Дакоте и Монтане, хотя он более широко адаптирован и исторически выращивался в других регионах США. Лен хорошо растет на почвах и в среде, где выращивают яровые злаки. Посев льна ранней весной, аналогично рекомендуемому сроку посева яровых зерновых культур, обычно дает более высокие урожаи. В южно-центральной части США ранняя посадка льна с последующим посевом гречихи предлагается как способ увеличения потенциальной прибыли в регионах с достаточно продолжительным вегетационным периодом.
Разновидности льна бывают желтыми или коричневыми. Конечные пользователи в пищевой промышленности обычно отдают предпочтение тому или иному цветовому типу, в зависимости от того, как будут использоваться семена. Цветотип менее важен, если лен измельчают на масло. Некоторые сорта были разработаны с повышенным содержанием омега-3 жирных кислот и могут иметь более высокую цену.
Поскольку спрос на льняную солому в настоящее время ограничен, обращение с льняными остатками может быть проблематичным, поскольку они медленно разлагаются в поле. Рекомендуется измельчать и разбрасывать солому при сборе урожая, а не сжигать.
Использование с добавленной стоимостью При использовании в качестве масла льняное семя обычно перерабатывают путем холодного отжима для получения льняного масла, пригодного для потребления человеком, и путем экстракции растворителем для получения льняного масла для промышленных целей. Техническое льняное масло используется в качестве олифы в красках и лаках, а также в таких продуктах, как линолеум и типографские краски. В прошлом спрос на льняное масло для линолеума, красок и других промышленных товаров был значительным. Более широкое использование красок на водной основе и напольных покрытий на нефтяной основе снизило этот спрос. В конце 19Однако в 90-х годах тенденция к здоровой и экологически чистой продукции начала создавать новые возможности для льняной промышленности.
Неаллергенные и биоразлагаемые характеристики линолеума для полов привели к возрождению спроса на линолеум в некоторых частях Европы.
Льняная мука является побочным продуктом переработки льняного семени в масло. Скармливание льняного семени птице и крупному рогатому скоту может изменить уровень омега-3 жирных кислот в яйцах и говядине (Scheideler et al. 1994, Maddock et al. 2003). Точно так же молоко из рационов молочного скота, включающих лен, показало повышенное содержание АЛК (Bork et al. 2010). Рационы для животных, содержащие льняное семя, повышают плодовитость свиней и иммунитет бычков (Maddock et al. 2005). Льняная мука набирает популярность в индустрии премиальных кормов для домашних животных. Многие производители кормов для домашних животных добавляют муку в свои корма для животных и птицы. Благодаря уникальному сочетанию аминокислот льняная мука улучшает как общее состояние здоровья, так и внешний вид кошек, собак и лошадей.
Люди могут потреблять лен в качестве добавки или ингредиента в различных продуктах питания.
Традиционно лен используется в качестве ингредиента в сухих завтраках и хлебе. Однако за последние десять лет для рынка продуктов здорового питания было разработано значительное количество продуктов, содержащих лен. Возобновление интереса к льну как к источнику пищи связано с выводами, свидетельствующими о том, что он может принести множество преимуществ для здоровья, таких как снижение риска сердечно-сосудистых заболеваний и рака. Лен богат пищевыми волокнами, очень высоким содержанием незаменимых жирных кислот и витаминов и минералов. С точки зрения питательных свойств лен содержит альфа-линоленовую кислоту (АЛК), незаменимую жирную кислоту омега-3. На самом деле процент АЛК во льне самый высокий среди всех растительных источников. Исследования также показывают, что потребление льна может иметь дополнительные преимущества для здоровья, связанные с аутоиммунной системой.
Хотя спрос в настоящее время ограничен, бумажная и целлюлозная промышленность использует волокно стеблей льна для изготовления льняных простыней, салфеток, скатертей и одежды, а также для тонкой бумаги, такой как пергаментная бумага и папиросная бумага.
Короткие льняные волокна можно смешивать с хлопком или другими волокнами для изготовления медицинских изделий, таких как бинты. Новые разработки сосредоточены на использовании льняной соломы в качестве альтернативного топлива. Солома льна имеет теплотворную способность на тонну, аналогичную мягкому углю, и, таким образом, имеет более высокую теплотворную способность, чем другие пожнивные остатки. Льняное волокно также рассматривается как более легкая и экологически чистая замена стекловолокна в автомобилях. Используя лен, канадский завод производит волокна для замены стекловолокна, которое в настоящее время используется для изготовления автомобильных деталей, таких как приборные панели.
Конкуренция за площади под льном по-прежнему будет жесткой, поскольку производство других товаров, которые легче выращивать и которые имеют более высокий потенциал урожайности, может быть более прибыльным или менее рискованным. Расширение рынка льна, скорее всего, произойдет за счет повышенного спроса на потребление человеком и экологически безопасного промышленного использования.
Статистические данные по предметам, NASS, USDA, 2020
Ежегодная сводка растениеводства, Национальная служба статистики сельского хозяйства (NASS), USDA.
Годовой обзор стоимости урожая, NASS, USDA.
Совет по льну Канады , Общая информация о производстве, использовании и сбыте льна в Канаде.
Глобальная система торговли сельскохозяйственной продукцией, Зарубежная сельскохозяйственная система, Министерство сельского хозяйства США.
Прогноз масличных культур, 2021 г., Служба экономических исследований, Министерство сельского хозяйства США.
Статистические данные по штатам, NASS, USDA
AmeriFlax, источник общей информации о льне в США
Справочники по производствуПроизводство льна в Северной Дакоте, Университет штата Северная Дакота, расширение
Лен, Университет штата Айова, расширение и распространение информации
Лен Пейдж, Университет штата Северная Дакота.
Глобальная система торговли сельскохозяйственной продукцией, Зарубежная сельскохозяйственная система, Министерство сельского хозяйства США.
Обзор масличных культур, Служба экономических исследований, Министерство сельского хозяйства США.
Статистические данные по штатам, NASS, USDA
Данные о генетическом полиморфизме льна (Linum usitatissimum L.) патогенных грибов родов Fusarium, Colletotrichum, Aureobasidium, Septoria и Melampsora
- Список журналов
- Краткое описание данных
- т.31; 2020 авг
- PMC7256288
Являясь библиотекой, NLM предоставляет доступ к научной литературе. Включение в базу данных NLM не означает одобрения или согласия с
содержание NLM или Национальных институтов здравоохранения.
Узнайте больше о нашем отказе от ответственности.
Краткий обзор данных. 2020 авг.; 31: 105710.
Опубликовано в сети 15 мая 2020 г. doi: 10.1016/j.dib.2020.105710
, a, # , a, 9010 6 б, # , а, с , с , д , а , а, 901 05 b , a , a , a , a, ⁎ и a
Информация об авторе Примечания к статье Информация об авторских правах и лицензии Отказ от ответственности
- Дополнительные материалы
Являясь ценным сельскохозяйственным растением, лен ( Linum usitatissimum L.) используется для производства масла и волокна. Однако при возделывании этого хозяйства остро стоит проблема восприимчивости льна к грибным заболеваниям. Наиболее разрушительные из них вызывают представители родов Fusarium, Colletotrichum, Aureobasidium, Septoria и Melampsora , значительно снижающие урожайность льна.
Для эффективной борьбы с такими патогенами очень важно оценить их генетическое разнообразие, что может быть использовано для разработки молекулярных маркеров для различения родов и видов грибов. Морфологический анализ, традиционно проводимый для идентификации грибов, требует определенного количества времени и, как правило, сложен. В настоящей работе мы определили последовательности ДНК, которые часто используются для филогенетических исследований у грибов – внутренний транскрибируемый спейсер (ITS) и бета-тубулин ( tub2 ), фактор элонгации трансляции 1-альфа ( tef1 ), наибольшая субъединица РНК-полимеразы II ( RPB1 ), вторая по величине субъединица РНК-полимеразы II ( RPB2 ) и поддерживающий белок минихромосомы ( MCM7 9001 0) гены – для 203 возбудителей грибов льна Fusarium oxysporum, F. avenaceum, F. solani, F. sporotrichiella, F. moniliforme, F. culmorum, F. semitectum, F. gibbosum, Colletotrichum lini, Aureobasidium pullulans, Septoria linicola и Melampsora lini видов.
Секвенирование проводили с использованием платформы Illumina MiSeq с набором 300+300 п.н., и в среднем было получено около 2350 прочтений на образец, что позволяет точно идентифицировать генетический полиморфизм. Необработанные данные хранятся в архиве чтения последовательностей под регистрационным номером PRJNA596387. Полученные данные могут быть использованы для филогенетических исследований грибов и разработки тест-системы на основе ПЦР для идентификации возбудителей болезней льна.
Ключевые слова: Грибы, фитопатогены, Fusarium , генетический полиморфизм, глубокое секвенирование, секвенирование ампликонов, лен, Linum usitatissimum L
Таблица спецификаций
| Генетика | |||
| Конкретная предметная область | Молекулярная генетика, сельскохозяйственная микология | ||
| Тип данных | Данные последовательности ампликона | 9018 8||
| Как были получены данные | Illumina MiSeq, считывания парных концов 300+300 п. н. | ||
| Формат данных | Чтение необработанных последовательностей, формат fastq | ||
| Параметры для сбора данных ) образцы грибковых патогенов Fusarium oxysporum, F. avenaceum, F. solani, F. sporotrichiella, F. moniliforme, F. culmorum, F. semitectum, F. gibbosum, Colletotrichum lini, Aureobasidium pullulans, Septoria linicola и Melampsora lini видов получены из коллекции фитопатогенов Института льна (Торжок, Россия) | |||
| Описание сбора данных | Ампликон библиотеки фрагментов внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS) и бета-тубулина ( tub2 ), фактора элонгации трансляции 1-альфа ( tef1 ), наибольшей субъединицы РНК-полимеразы II ( 90 009 RPB1 ), второй по величине субъединицы РНК-полимеразы II ( RPB2 ) и поддерживающего белка минихромосомы ( MCM7 ) генов грибов-возбудителей льна Fusarium, Colletotrichum, Aureobasidium, Septoria и Роды Melampsora были получены с помощью двухэтапной ПЦР и секвенированы на Illumina MiSeq с набором на 600 циклов | ||
| Источник данных | Институт льна, Торжок, Россия | Доступ к данным | Доступ к данным о последовательности ампликона можно получить в архиве NCBI Sequence Read Archive (SRA) под регистрационным номером PRJNA596387 (https://www. ncbi.nlm.nih.gov/sra/PRJNA596387) |
•
Набор данных может быть активно использован для оценки генетического разнообразия и филогенетических исследований грибов, принадлежащих к родам Fusarium, Colletotrichum, Aureobasidium, Septoria и Melampsora .
•
Данные могут помочь тем, кто работает в области молекулярной генетики грибов, а также тем, кто работает с грибковыми патогенами растений.
•
Родство и эволюция грибов родов Fusarium, Colletotrichum, Aureobasidium, Septoria и родов Melampsora можно оценить с использованием предоставленного набора данных.
•
Полученные данные открывают возможность создания тест-системы для идентификации возбудителей болезней льна на основе информации о генетическом полиморфизме.
Являясь источником масла и клетчатки [1], лен поражается многочисленными грибковыми возбудителями.
Наиболее серьезные заболевания этого растения вызывают представители таких видов, как Fusarium oxysporum f. сп. lini, F. avenaceum, F. culmorum, Melampsora lini, Colletotrichum lini, Septoria linicola и Aureobasidium pullulans [2,3]. Сведения о генетическом разнообразии перечисленных видов отсутствуют, но имеют большое значение для установления их родства и эволюции, а также для разработки эффективных способов борьбы с этими возбудителями болезней льна.
На 203 образца возбудителей болезней льна Fusarium, Colletotrichum, Aureobasidium, Septoria и родов Melampsora секвенировали фрагменты участков, которые часто используются для филогенетических исследований у грибов: внутренний транскрибируемый спейсер (ITS) [4,5], бета-тубулин ( tub2 ), трансляционный фактор элонгации 1-альфа ( tef1 ), РНК-полимераза II субъединица ( RPB1 ), вторая по величине субъединица РНК-полимеразы II ( RPB2 ) и поддерживающий белок минихромосомы ( MCM7 ) [6], [7], [8].
Библиотеки ампликонов были подготовлены с использованием двухэтапной ПЦР (праймеры для первой стадии ПЦР перечислены в дополнительной таблице S1) и глубоко секвенированы на платформе Illumina MiSeq. В среднем в формате fastq было получено 2350 (диапазон – 400-6000) прочтений парных концов (300+300 п.н.) на образец, которые депонированы в Sequence Read Archive (SRA) под инвентарным номером PRJNA59.6387. Эти данные играют ключевую роль в оценке генетического разнообразия возбудителей грибов льна и разработке экономящих время и точных тест-систем для их идентификации. Основываясь на данном наборе данных, будущие эксперименты, вероятно, дадут более глубокое понимание вопроса о родстве и эволюции грибов изучаемых родов.
2.1. Материал
203 образца 12 видов грибов предоставлены Институтом льна (Торжок, Россия) из коллекции фитопатогенов в 2018 г. Из них Fusarium oxysporum (72 образца), F. avenaceum (23), F. solani (5), F. sporotrichiella (3), F.
moniliforme (8), F. cul morum (5), F. semitectum (2), F. gibbosum (4), Colletotrichum lini (46), Aureobasidium pullulans (17), Septoria linicola (8 ), и Melampsora lini (10) видов.
2.2. Экстракция ДНК и контроль качества
9ДНК 0002 выделяли из мицелия грибов по стандартному протоколу CTAB. Для контроля качества ДНК и оценки количества ДНК использовали электрофорез в агарозном геле (2% агарозы) и флуориметр Qubit 2.0 (Thermo Fisher Scientific, США).2.3. Подготовка библиотеки ДНК и секвенирование
Мы амплифицировали фрагменты ДНК 203 образцов грибов, содержащих ITS и генов tub2, tef1, RPB1, RPB2 и MCM7 . Библиотеки ампликонов готовили по протоколу [9].] с двухэтапной ПЦР, как мы описали ранее [10]. На первом этапе была проведена амплификация последовательностей-мишеней с использованием праймеров, содержащих специфические для мишени последовательности [8,11] и выступающие адаптеры (дополнительная таблица S1).
Затем для каждого образца ампликоны объединяли эквимолярно и проводили вторую ПЦР с праймерами, состоящими из штрих-кодов с двойным индексом и адаптеров для секвенирования. Далее все ПЦР-продукты эквимолярно объединяли и качество библиотеки оценивали на биоанализаторе 2100 (Agilent Technologies, США), а количество – на флуорометре Qubit 2.0 (Thermo Fisher Scientific). Библиотеку секвенировали с использованием платформы MiSeq (Illumina, США) и набора реагентов Illumina MiSeq Reagent Kit v3 (чтения 2×300 п.н.).
Часть этой работы (Секвенирование штаммов Fusarium oxysporum ) выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда [номер гранта 16-16-00114]. Часть работы (Секвенирование штаммов родов Fusarium, Colletotrichum, Aureobasidium, Septoria и Melampsora ) выполнена при финансовой поддержке Гранта Президента РФ [номер гранта МК-5828.2018.4]. Содержание коллекции возбудителей болезней льна осуществляется при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации [номер государственного задания 075-00853-19-00].
Мы благодарим Центр точного редактирования генома и генетических технологий для биомедицины ЕИМБ РАН за предоставление методов направленного глубокого секвенирования. Секвенирование проводили на оборудовании центра «Геном» ЕИМБ РАН (http://www.eimb.ru/ru1/ckp/ccu_genome_ce.php).
Конфликт интересов
Авторы заявляют, что у них нет известных конкурирующих финансовых интересов или личных отношений, которые оказали или могут быть восприняты как оказавшие влияние на работу, описанную в этой статье.
Дополнительные материалы, связанные с этой статьей, можно найти в онлайн-версии по адресу doi:10.1016/j.dib.2020.105710.
Приложение A. Дополнительные данные
Щелкните здесь для просмотра. (17K, docx) Изображение, приложение 1
Щелкните здесь для просмотра. (1.3K, xml) Изображение, приложение 2
1. Cullis C.A. Спрингер; Cham: 2019. Генетика и геномика Linum. [Google Scholar]
2. Нивалл Р.Ф. Болезни льна. В: Нивалл Р.
Ф., редактор. Справочник по болезням полевых культур. Спрингер; Бостон: 1989. стр. 251–264. [Google Scholar]
3. Груздевене Э., Бразаускене И., Репечкене Ю., Лугаускас А. Возникновение патогенных грибов в период вегетации льна в Центральной Литве. J Plant Prot Res. 2008; 48: 255–266. doi: 10.2478/v10045-008-0029-2. [CrossRef] [Google Scholar]
4. Schoch C.L., Seifert K.A., Huhndorf S., Robert V., Spouge J.L., Levesque C.A., Chen W., Fungal Barcoding Consortium C. Ядерный рибосомный внутренний транскрибируемый спейсер (ITS) как универсальный ДНК-маркер штрих-кода для грибов. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012;109: 6241–6246. doi: 10.1073/pnas.1117018109. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
5. Прайс Т.М., Палладино С., Кей И.Д., Кумбс Г.В. Быстрая идентификация грибов путем секвенирования областей ITS1 и ITS2 с использованием автоматизированной системы капиллярного электрофореза. Мед Микол. 2003; 41: 369–381. doi: 10.1080/13693780310001600435.
[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
6. Crous P.W., Hawksworth D.L., Wingfield M.J. Идентификация и наименование фитопатогенных грибов: прошлое, настоящее и будущее. Анну Рев Фитопат. 2015; 53: 247–267. doi: 10.1146/annurev-phyto-080614-120245. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]
7. О’Доннелл К., Саттон Д.А., Ринальди М.Г., Сарвер Б.А., Баладжи С.А., Шроерс Х.Дж., Саммербелл Р.К., Роберт В.А., Краус П.В., Чжан Н., Аоки Т., Юнг К., Парк Дж., Ли Ю.Х., Канг С., Парк Б., Гейзер Д.М. . Доступная в Интернете база данных последовательностей ДНК для идентификации фузариоза от инфекций человека и животных. Дж. Клин Микробиол. 2010;48:3708–3718. doi: 10.1128/JCM.00989-10. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
8. Раджа Х.А., Миллер А.Н., Пирс С.Дж., Оберлис Н.Х. Идентификация грибов с использованием молекулярных инструментов: учебник для сообщества исследователей натуральных продуктов. J Nat Prod. 2017; 80: 756–770. doi: 10.1021/acs.jnatprod.6b01085.
[Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
9. Центр поддержки Illumina, Подготовка библиотеки метагеномного секвенирования 16S. support.illumina.com/downloads/16s_metagenomic_sequencing_library_preparation.html, 2019 г. (по состоянию на 20 ноября 2019 г.).
10. Мельникова Н.В., Кудрявцева А.В., Борхерт Е.В., Пушкова Е.Н., Федорова М.С., Снежкина А.В., Краснов Г.С., Дмитриев А.А. Половой полиморфизм генов MET1 и ARR17 у Populus x sibirica. Биохимия. 2019;162:26–32. doi: 10.1016/j.biochi.2019.03.018. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]
11. Matheny P.B., Wang Z., Binder M., Curtis J.M., Lim Y.W., Nilsson R.H., Hughes K.W., Hofstetter V., Ammirati J.F., Schoch C.L., Langer E., Langer G., McLaughlin D.J., Wilson A.W., Froslev T., Ge Z. W., Kerrigan R.W., Slot J.C., Yang Z.L., Baroni T.J., Fischer M., Hosaka K., Matsuura K., Seidl M.T., Vauras J., Hibbett D.S. Вклад rpb2 и tef1 в филогению грибов и их союзников (Basidiomycota, Fungi) Mol Phylogenet E.