Проект "1000 геномов" принес первые плоды. Проект 1000

Проект "1000 геномов" принес первые плоды

Международный проект "1000 геномов", участники которого намерены составить первый в истории "каталог" вариаций генома, вызывающих, в частности, различные болезни, опубликовал первые результаты своей работы: расшифровку геномов 179 человек, в числе которых жители Нигерии, Японии, Китая и США, а также результаты анализа более 8 тысяч отдельных участков генов.

МОСКВА, 27 окт - РИА Новости. Международный проект "1000 геномов", участники которого намерены составить первый в истории "каталог" вариаций генома, вызывающих, в частности, различные болезни, опубликовал первые результаты своей работы: расшифровку геномов 179 человек, в числе которых жители Нигерии, Японии, Китая и США, а также результаты анализа более 8 тысяч отдельных участков генов.

Результаты исследования и его методы описаны в двух статьях, опубликованных в самых престижных научных журналах - Nature и Science. Сами генетические данные, как и все другие, которые получили и получат участники проекта, будут выложены в интернете и доступны для специалистов и публики.

Проект "1000 геномов" (The 1000 Genomes Project) был запущен в 2008 году. В нем работает множество исследовательских организаций, в частности, из США, Великобритании, Дании, Германии, Финляндии, Китая, Южной Кореи, Франции и Швейцарии. Российские институты в проекте не участвуют. Основная цель "1000 геномов" - обнаружить и описать более 95% генетических вариаций, которые встречаются у людей с частотой больше 1%.

Для этого они планируют к 2012 году секвенировать геномы более 2,5 тысячи человек, принадлежащих к пяти большим популяционным группам. Это амбициозная задача, учитывая, что впервые геном человека был прочитан менее десяти лет назад, а совсем недавно количество расшифрованных полных геномов составляло лишь десятки.

Итогом первой, пилотной фазы работы проекта стали 179 геномов, прочитанных с относительно низкой надежностью - от двух до шести проходов (повторных чтений генетической последовательности). В это число вошли геномы жителей американского штата Юта, китайцев - жителей Пекина, японцев, живущих в Токио, членов нигерийского племени йоруба.

Кроме того, с высокой надежностью (42 прохода) были прочитаны геномы членов двух семей, каждая из которых состояла из двух родителей и дочери. Одна семья принадлежала к племени йоруба, а вторая была из штата Юта.

Во время первой фазы были также расшифрованы 8,14 тысячи генетических фрагментов (экзонов), взятых у 697 человек из Европы, Японии, США, Китая, Кении и Нигерии.

"Количество информации, полученной на этой, первой фазе проекта, примечательно. Менее чем за два года мы идентифицировали 15 миллионов однонуклеотидных замен (single nucleotide polymorphisms - SNPs), 1 миллион выпадений или вставок участков ДНК и 20 тысяч более значительных расхождений участков геномов", - сообщил сопредседатель проекта Ричард Дурбин (Richard Durbin) из британского Института Сангера.

"Большая часть этих вариантов - около 8 миллионов - не были известны ранее. Это самый большой каталог генетических данных, и он находится в открытом доступе, чтобы помочь увеличить эффективность генетических исследований", - отметил он.

Систематический каталог генетических изменений даст ученым основу для изучения связи между генами и повышенным риском тех или иных заболеваний у конкретного человека, и в конечном счете может начать новую эру в генетике и медицине.

Все генетические варианты, обнаруженные во время пилотной фазы, теперь могут быть проверены на связь с тем или иным заболеванием или особенностью человека (например, со склонностью к ожирению или с повышенным риском наркомании).

ria.ru

Проект:1000 Википедия

Оценка качества

По списку 1000 статей сравнивают качество разделов Википедии — как правило, в начале каждого месяца. В соответствии с критериями сравнения, все статьи разделены на три категории:

Короткие, то есть меньше 10 000 символов,
Средние статьи, то есть больше 10 000 символов, но меньше 30 000 символов,
Длинные статьи, больше 30 000 символов.

Задачей участников проекта и Википедии в целом должно быть доведение до уровня длинных статей всех статей этого списка.

В данном разделе будут приводиться основные недостатки статей из 1000. Целью является проверка статей, выявление и исправление недостатков. Участник, выявивший в статье существенные недостатки, может добавить запись в таблицу.

Статья К улучшению Проверил Австралия, Достоевский, Ирак, Африка, Сталин, Культура, Информация, Мужчина, Олово, Арабский язык, Терроризм, Смерть, Марксизм, Колумб, Тесла, Никола, Перевод, Леонардо да Винчи, Мумбаи, Мао Цзэдун, Паукообразные, Суэцкий канал Крестовые походы, Диккенс, Чарльз Нанотехнология Канада, Нью-Йорк, Шииты, Кубрик, Стэнли Содружество Независимых Государств, Город, Килограмм, Алжир, Китайская Народная Республика, Ирак, Пекин, Жёсткий диск, Аборт, Аральское море, Древесина, Книгопечатание, Гончарное производство, Орошение Транспорт Биологический вид, Соя

Достоверность фактов под сомнением (шаблон {{достоверность}} в одном из разделов)	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Статьи к полной переработке	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Возможные проблемы с грамматикой и орфографией	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Возможные проблемы с переводом (шаблон {{плохой перевод}})	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Устаревшая информация в статье	--Шуфель 14:22, 25 января 2013 (UTC)
Не написано про историю орошения в XX веке и про механизмы орошения	--Andreykor 15:43, 28 марта 2012 (UTC)
Статья неплохая, тема в принципе раскрыта; но мало ссылок на источники	--Brateevsky {talk} 16:52, 9 апреля 2012 (UTC)
Запросы источника	--DimaNižnik 19:58, 10 декабря 2016 (UTC)

Звёздный рейтинг

Наши проекты

Текущие значения русской Википедии: 1 отсутствующая,1 средняя и 998 длинных статей, рейтинг: 99.84.Обогнали английский раздел на 5.52, до каталанского раздела не хватает 0.1, до максимального рейтинга не хватает 0.16.

TOP-9 на начало ноября 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	64,934	43,388	0	0	0	1,000	100.00	+0.09
2	ca	Català	1.1	46,690	36,934	0	0	2	998	99.89	+0.00
3	en	English	1.0	79,915	69,889	0	7	120	873	92.71	+0.11
4	zh	中文	3.7	63,270	37,103	0	0	186	813	89.66	+1.17
5	uk	Українська	1.3	38,506	32,917	0	0	356	644	80.22	+0.26
6	fr	Français	1.0	57,792	40,352	5	90	275	629	76.20	+0.23
7	de	Deutsch	1.0	52,314	37,748	10	78	317	595	74.46	+0.09
8	es	Español	1.1	53,150	36,114	4	81	327	588	74.23	+0.07
9	bg	Български	1.1	26,370	30,274	1	1	474	524	73.48	+0.32

TOP-9 на начало июля 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	64,283	42,709	0	0	1	999	99.94	+0.38
2	ca	Català	1.1	46,582	36,914	0	1	0	999	99.91	-0.09
3	en	English	1.0	78,471	69,415	0	7	126	867	92.38	+0.09
4	zh	中文	3.7	60,358	35,816	0	1	248	751	86.13	+0.24
5	uk	Українська	1.3	37,817	32,773	0	1	366	633	79.58	+0.15
6	fr	Français	1.0	56,752	39,686	6	92	287	615	75.28	+0.05
7	de	Deutsch	1.0	51,601	36,825	10	77	318	595	74.49	+0.27
8	es	Español	1.1	52,511	35,719	4	85	328	583	73.82	+0.11
9	bg	Български	1.1	26,159	30,233	2	1	478	519	73.16	-0.04

TOP-9 на начало июня 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ca	Català	1.1	46,602	36,902	0	0	0	1,000	100.00	+0.00
2	ru	Русский	1.4	64,087	42,781	3	1	1	995	99.56	-0.24
3	en	English	1.0	78,202	68,904	0	8	126	866	92.29	+0.10
4	zh	中文	3.7	59,825	35,627	0	0	254	746	85.89	+0.61
5	uk	Українська	1.3	37,718	32,732	0	2	367	631	79.43	+0.02
6	fr	Français	1.0	56,458	39,363	5	93	288	614	75.23	+0.20
7	de	Deutsch	1.0	51,377	36,423	11	77	321	591	74.22	+0.12
8	es	Español	1.1	52,270	35,713	4	85	330	581	73.71	+0.73
9	bg	Български	1.1	26,048	30,225	1	1	479	519	73.20	+0.17

TOP-9 на начало апреля 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ca	Català	1.1	46,509	36,837	0	0	0	1,000	100.00	+0.06
2	ru	Русский	1.4	63,657	42,634	0	0	0	1,000	100.00	+0.00
3	en	English	1.0	77,646	68,440	0	8	127	865	92.23	+0.22
4	zh	中文	3.7	58,430	35,201	0	0	284	716	84.22	+1.16
5	uk	Українська	1.3	37,492	32,706	2	0	369	629	79.30	-0.03
6	fr	Français	1.0	56,182	39,313	5	94	291	610	74.98	-0.11
7	de	Deutsch	1.0	51,004	36,331	9	79	324	588	74.08	+0.07
8	bg	Български	1.1	25,996	30,199	2	2	479	517	73.01	+0.04
9	es	Español	1.1	51,849	35,576	5	97	322	576	72.99	-0.10

TOP-9 на начало февраля 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	63,334	42,320	0	0	0	1,000	100.00	+0.00
2	ca	Català	1.1	46,339	36,719	0	0	1	999	99.94	+0.00
3	en	English	1.0	76,662	67,475	0	8	131	861	92.01	+0.14
4	zh	中文	3.7	57,523	34,965	0	1	311	688	82.63	+1.35
5	uk	Українська	1.3	37,203	32,645	0	1	373	626	79.19	+0.22
6	fr	Français	1.0	55,633	38,833	5	92	293	610	75.04	+0.00
7	de	Deutsch	1.0	50,520	36,264	9	81	321	589	74.07	-0.03
8	bg	Български	1.1	25,853	30,168	2	2	482	514	72.84	+0.52
9	es	Español	1.1	51,630	35,405	6	96	328	570	72.64	+0.11

TOP-9 на начало января 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	63,032	42,075	0	0	0	1,000	100.00	+0.10
2	ca	Català	1.1	46,230	36,687	0	0	1	999	99.94	+0.10
3	en	English	1.0	76,243	67,163	0	9	132	859	91.87	+0.26
4	zh	中文	3.7	56,358	34,472	1	2	332	665	81.28	+1.18
5	uk	Українська	1.3	37,115	32,630	0	1	377	622	78.97	+0.31
6	fr	Français	1.0	55,346	38,602	5	92	293	610	75.04	+0.26
7	de	Deutsch	1.0	50,296	35,980	9	80	322	589	74.10	+0.26
8	es	Español	1.1	51,110	35,129	8	95	328	569	72.53	+0.03
9	bg	Български	1.1	25,418	30,063	2	2	491	504	72.32	+0.41

TOP-9 на начало сентября 2013 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ca	Català	1.1	45,779	36,641	0	0	0	1,000	100.00	+0.10
2	ru	Русский	1.4	61,823	41,574	0	0	0	1,000	100.00	+0.06
3	en	English	1.0	74,967	66,050	3	9	133	855	91.51	-0.25
4	uk	Українська	1.3	36,597	32,423	1	0	386	613	78.46	-0.05
5	zh	中文	3.7	53,846	32,282	1	0	428	571	76.12	+1.40
6	fr	Français	1.0	54,166	37,445	3	98	299	600	74.38	+0.16
7	de	Deutsch	1.0	49,553	35,671	11	83	331	575	73.13	-0.33
8	es	Español	1.1	50,482	33,929	7	97	338	558	71.90	-0.08
9	bg	Български	1.1	24,471	18,766	1	3	529	467	70.24	+0.90

Дополненные статьи и авторы

27 октября 2013‎ — Басня — Ace111
31 октября 2013‎ — Шуберт, Франц — Andreykor
31 октября 2013‎ — Конго (река) — Andreykor

wikiredia.ru

Проект «1000 агрономов» – НССиС

В Башкирском НИИСХ повысят квалификацию 1000 специалистов.

В Башкирском НИИ сельского хозяйства УФИЦ РАН стартовали курсы повышения квалификации последнего потока главных агрономов муниципальных районов, сельскохозяйственных организаций и фермерских хозяйств республики.

Новый формат обучения специалистов перед началом весенне-полевых работ был инициирован Министерством сельского хозяйства республики в рамках проекта «1000 агрономов», согласно которому в течение года должно быть обучено не меньшее количество специалистов.

Главная цель программы «Новые технологии устойчивого развития отраслей растениеводства» — повышение компетенций в области агротехнологий, селекции и семеноводства, органического земледелия, комплексных методов защиты растений, обучение передовым методам работы в растениеводстве. С учетом пожеланий слушателей по тематике занятий для выступлений были приглашены ученые Башкирского НИИ сельского хозяйства, Башкирского государственного аграрного университета, представители федеральных надзорных органов, а также фирм–производителей семян, средств защиты растений.

Сегодня углубили свои знания более 400 специалистов. Как отметил заместитель министра сельского хозяйства РБ Ирек Сураков, этим программа не ограничивается. Ее главная особенность — симбиоз теории и практики. В теоретической части, во время проведения зональных агрономических конференций, Дня поля, большое значение уделят обзору лучших практик и методик внедрения полученных результатов, апробации представленных технологий.

«Местом проведения обучения Башкирский НИИ сельского хозяйства выбран неслучайно. Это один из ведущих научных учреждений страны в области селекции, где создано более 270 сортов сельскохозяйственных культур. Из них 193 сорта включены в Госреестр селекционных достижений России. Кроме того, выведены два внутрипородных типа лошадей. Сотрудниками института успешно разрабатываются эффективные приемы воспроизводства почвенного плодородия, адаптивных систем земледелия и ресурсосберегающих технологий производства продукции растениеводства и животноводства», — отметила сотрудник пресс-службы Башкирского НИИ сельского хозяйства УФИЦ РАН Гульдар Нуриева.

Источник

Post Views: 314

www.nsss-russia.ru

Проект 1000 геномов человека - Дом Солнца

Из полученного в результате большого количество информации ученые смогут извлечь множество новых данных о генетических отличиях в популяции людей.

Сейчас специалисты завершили три этапа этого проекта. В ходе первого этапа ученые получили очень подробные сведения о "смысловых" участках тысячи генов - так называемых экзонах. Экзоны содержат генетическую информацию, которая непосредственно переводится на "язык" аминокислот, то есть на ее основе синтезируются белки. Помимо экзонов каждый ген содержит большие участки ДНК, которые никак не отражаются в аминокислотной последовательности, хотя и необходимы для правильного синтеза белков (их называют интроны).

Второй этап проекта "1000 геномов человека" заключался в получении подробных и надежных последовательностей ДНК шести человек. Геном каждого из них был "прочитан" несколько раз - в среднем, от 20 до 60. Люди, ДНК которых изучалась, являются родственниками, так что полученная информация поможет ученым исследовать изменения ДНК в семьях. Кроме того, расшифровывая геномные последовательности, исследователи намеренно использовали несколько существующих технологий и могли сравнить их эффективность.

В ходе третьего этапа были с меньшей степенью надежности определены последовательности ДНК еще 179 человек (в среднем каждый образец был "прочитан" четыре раза).

Проект "1000 геномов человека" стартовал в январе 2008 года и рассчитан на три года. Ожидается, что ученые потратят около 30-50 миллионов долларов, что относительно немного по сравнению со стоимостью проекта "Геном человека", в рамках которого была впервые получены полная геномная последовательность Homo sapiens -тогда на работы было потрачено не менее трех миллиардов долларов.

www.sunhome.ru

Проект:1000 важнейших статей Википедия

Оценка качества

Короткие, то есть меньше 10 000 символов,
Средние статьи, то есть больше 10 000 символов, но меньше 30 000 символов,
Длинные статьи, больше 30 000 символов.

Достоверность фактов под сомнением (шаблон {{достоверность}} в одном из разделов)	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Статьи к полной переработке	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Возможные проблемы с грамматикой и орфографией	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Возможные проблемы с переводом (шаблон {{плохой перевод}})	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Устаревшая информация в статье	--Шуфель 14:22, 25 января 2013 (UTC)
Не написано про историю орошения в XX веке и про механизмы орошения	--Andreykor 15:43, 28 марта 2012 (UTC)
Статья неплохая, тема в принципе раскрыта; но мало ссылок на источники	--Brateevsky {talk} 16:52, 9 апреля 2012 (UTC)
Запросы источника	--DimaNižnik 19:58, 10 декабря 2016 (UTC)

Звёздный рейтинг

Наши проекты

TOP-9 на начало ноября 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	64,934	43,388	0	0	0	1,000	100.00	+0.09
2	ca	Català	1.1	46,690	36,934	0	0	2	998	99.89	+0.00
3	en	English	1.0	79,915	69,889	0	7	120	873	92.71	+0.11
4	zh	中文	3.7	63,270	37,103	0	0	186	813	89.66	+1.17
5	uk	Українська	1.3	38,506	32,917	0	0	356	644	80.22	+0.26
6	fr	Français	1.0	57,792	40,352	5	90	275	629	76.20	+0.23
7	de	Deutsch	1.0	52,314	37,748	10	78	317	595	74.46	+0.09
8	es	Español	1.1	53,150	36,114	4	81	327	588	74.23	+0.07
9	bg	Български	1.1	26,370	30,274	1	1	474	524	73.48	+0.32

TOP-9 на начало июля 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	64,283	42,709	0	0	1	999	99.94	+0.38
2	ca	Català	1.1	46,582	36,914	0	1	0	999	99.91	-0.09
3	en	English	1.0	78,471	69,415	0	7	126	867	92.38	+0.09
4	zh	中文	3.7	60,358	35,816	0	1	248	751	86.13	+0.24
5	uk	Українська	1.3	37,817	32,773	0	1	366	633	79.58	+0.15
6	fr	Français	1.0	56,752	39,686	6	92	287	615	75.28	+0.05
7	de	Deutsch	1.0	51,601	36,825	10	77	318	595	74.49	+0.27
8	es	Español	1.1	52,511	35,719	4	85	328	583	73.82	+0.11
9	bg	Български	1.1	26,159	30,233	2	1	478	519	73.16	-0.04

TOP-9 на начало июня 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ca	Català	1.1	46,602	36,902	0	0	0	1,000	100.00	+0.00
2	ru	Русский	1.4	64,087	42,781	3	1	1	995	99.56	-0.24
3	en	English	1.0	78,202	68,904	0	8	126	866	92.29	+0.10
4	zh	中文	3.7	59,825	35,627	0	0	254	746	85.89	+0.61
5	uk	Українська	1.3	37,718	32,732	0	2	367	631	79.43	+0.02
6	fr	Français	1.0	56,458	39,363	5	93	288	614	75.23	+0.20
7	de	Deutsch	1.0	51,377	36,423	11	77	321	591	74.22	+0.12
8	es	Español	1.1	52,270	35,713	4	85	330	581	73.71	+0.73
9	bg	Български	1.1	26,048	30,225	1	1	479	519	73.20	+0.17

TOP-9 на начало апреля 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ca	Català	1.1	46,509	36,837	0	0	0	1,000	100.00	+0.06
2	ru	Русский	1.4	63,657	42,634	0	0	0	1,000	100.00	+0.00
3	en	English	1.0	77,646	68,440	0	8	127	865	92.23	+0.22
4	zh	中文	3.7	58,430	35,201	0	0	284	716	84.22	+1.16
5	uk	Українська	1.3	37,492	32,706	2	0	369	629	79.30	-0.03
6	fr	Français	1.0	56,182	39,313	5	94	291	610	74.98	-0.11
7	de	Deutsch	1.0	51,004	36,331	9	79	324	588	74.08	+0.07
8	bg	Български	1.1	25,996	30,199	2	2	479	517	73.01	+0.04
9	es	Español	1.1	51,849	35,576	5	97	322	576	72.99	-0.10

TOP-9 на начало февраля 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	63,334	42,320	0	0	0	1,000	100.00	+0.00
2	ca	Català	1.1	46,339	36,719	0	0	1	999	99.94	+0.00
3	en	English	1.0	76,662	67,475	0	8	131	861	92.01	+0.14
4	zh	中文	3.7	57,523	34,965	0	1	311	688	82.63	+1.35
5	uk	Українська	1.3	37,203	32,645	0	1	373	626	79.19	+0.22
6	fr	Français	1.0	55,633	38,833	5	92	293	610	75.04	+0.00
7	de	Deutsch	1.0	50,520	36,264	9	81	321	589	74.07	-0.03
8	bg	Български	1.1	25,853	30,168	2	2	482	514	72.84	+0.52
9	es	Español	1.1	51,630	35,405	6	96	328	570	72.64	+0.11

TOP-9 на начало января 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	63,032	42,075	0	0	0	1,000	100.00	+0.10
2	ca	Català	1.1	46,230	36,687	0	0	1	999	99.94	+0.10
3	en	English	1.0	76,243	67,163	0	9	132	859	91.87	+0.26
4	zh	中文	3.7	56,358	34,472	1	2	332	665	81.28	+1.18
5	uk	Українська	1.3	37,115	32,630	0	1	377	622	78.97	+0.31
6	fr	Français	1.0	55,346	38,602	5	92	293	610	75.04	+0.26
7	de	Deutsch	1.0	50,296	35,980	9	80	322	589	74.10	+0.26
8	es	Español	1.1	51,110	35,129	8	95	328	569	72.53	+0.03
9	bg	Български	1.1	25,418	30,063	2	2	491	504	72.32	+0.41

TOP-9 на начало сентября 2013 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ca	Català	1.1	45,779	36,641	0	0	0	1,000	100.00	+0.10
2	ru	Русский	1.4	61,823	41,574	0	0	0	1,000	100.00	+0.06
3	en	English	1.0	74,967	66,050	3	9	133	855	91.51	-0.25
4	uk	Українська	1.3	36,597	32,423	1	0	386	613	78.46	-0.05
5	zh	中文	3.7	53,846	32,282	1	0	428	571	76.12	+1.40
6	fr	Français	1.0	54,166	37,445	3	98	299	600	74.38	+0.16
7	de	Deutsch	1.0	49,553	35,671	11	83	331	575	73.13	-0.33
8	es	Español	1.1	50,482	33,929	7	97	338	558	71.90	-0.08
9	bg	Български	1.1	24,471	18,766	1	3	529	467	70.24	+0.90

Дополненные статьи и авторы

27 октября 2013‎ — Басня — Ace111
31 октября 2013‎ — Шуберт, Франц — Andreykor
31 октября 2013‎ — Конго (река) — Andreykor

wikiredia.ru

Проект «1000 геномов»: пятилетний план перевыполнен

Вторая фаза проекта «1000 геномов» завершена. В результате пятилетнего исследования секвенированы и проанализированы геномы 1092 представителей 14 различных популяций.

Конечная цель этого грандиозного международного проекта – предоставление биологам и практикующим врачам информации, которая поможет разобраться в нормальном спектре генетических вариантов, составляющих человеческий геном. Это, в свою очередь, позволит интерпретировать содержащуюся в геноме информацию в более широком контексте.

Проанализированные популяции были выбраны на основе данных об их миграционной истории и генетической взаимосвязи друг с другом. В каждой популяции случайным образом выбирались здоровые доноры, не состоящие в родственных связях. Из собранных образцов крови были выделены клетки, из которых вырастили клеточные линии, пригодные для бесконечного хранения и размножения. ДНК выделенных клеток была секвенирована, а полученные данные – внесены в общедоступные базы данных.

После публикации в 2003 году последовательности первого секвенированного человеческого генома специалистам стало ясно, что, вопреки традиционным представлениям, 98,5% генетического материала человека не кодирует белки. В настоящее время ученым известны функции ряда некодирующих регионов генома, однако бОльшая часть генетической последовательности до сих пор остается загадкой.

Существуют причины предполагать, что по крайней мере часть «темной материи» в геноме ответственна за предрасположенность к различным заболеваниям.

Генетические вариации, выявленные у представителей проанализированных популяций, разделили на категории в зависимости от частоты встречаемости. Варианты, выявляемые более чем в 5% образцов, считались распространенными, в 0,5-5% образцов – малораспространенными, а менее чем в 0,5% образцов – редкими.

14 проанализированных популяций поделили на 4 группы: европейского, африканского, восточно-азиатского и американского происхождения. Как и ожидали исследователи, бОльшая часть распространенных вариантов уже была идентифицирована в рамках более ранних работ, при этом частота их встречаемости мало варьировала в зависимости от происхождения группы.

Напротив, 58% малораспространенных и 87% редких вариантов было описано впервые. В некоторых случаях редкие варианты встречались в какой-то конкретной популяции в два раза чаще, чем в более обширной группе, включающей эту популяцию. В различных популяциях также выявлялись разные количества редких вариантов, самое большое разнообразие которых было характерно для испанской, финской и афро-американской популяций.

Совершенной неожиданностью оказалось то, что, в отношении редких вариантов, здоровые участники исследования являлись носителями от 130 до 400 вариантов, меняющих структуру белковых молекул, 10-20 вариантов, лишающих кодируемые ими белки способности выполнять присущие им функции, 2-5 вариантов, нарушающих функции белков и 1-2 вариантов, ассоциированных со злокачественными опухолями. Это означает, что здоровые люди, независимо от этнического происхождения, являются носителями примерно одинакового количества редких опасных для здоровья генетических вариантов.

По словам одного из руководителей исследования, профессора Аравинда Чакраварти (Aravinda Chakravarti) из университета Джонса Хопкинса, существует целый ряд факторов, обеспечивающих выживание людей, несмотря на наличие в их геномах такого большого количества ошибок. Одним из механизмов является то, что мутантная аллель присутствует только на одной хромосоме из пары, и для нормальной жизнедеятельности организму достаточно второго, нормального варианта гена. Еще одним фактором является наличие в других регионах генома «резервных» генов, способных в некоторых случаях компенсировать последствия нефункциональности того или иного белка.

Первая фаза проекта «1000 геномов» завершилась в 2008 году. Она была запланирована как предварительное изучение части геномов, секвенированных для второй фазы, и продемонстрировала целесообразность поиска генетических маркеров разных заболеваний. В рамках финальной фазы проекта планируется секвенировать геномы еще 1500 человек из 11 неохваченных ранее популяций. В проекте уже приняло участие более 100 ученых из 111 исследовательских учреждений всего мира.

Статья The 1000 Genomes Project Consortium. An integrated map of genetic variation from 1,092 human genomes опубликована в открытом доступе в журнале Nature.

Евгения РябцеваПортал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru по материалам Newswise: Scientific Team Sequences 1092 Human Genomes to Determine Standard Range of Human Genetic Variation.

02.11.2012

www.vechnayamolodost.ru

Проект:1000 Вики

Оценка качества

Короткие, то есть меньше 10 000 символов,
Средние статьи, то есть больше 10 000 символов, но меньше 30 000 символов,
Длинные статьи, больше 30 000 символов.

Достоверность фактов под сомнением (шаблон {{достоверность}} в одном из разделов)	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Статьи к полной переработке	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Возможные проблемы с грамматикой и орфографией	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Возможные проблемы с переводом (шаблон {{плохой перевод}})	--Шуфель 11:26, 30 августа 2013 (UTC)
Устаревшая информация в статье	--Шуфель 14:22, 25 января 2013 (UTC)
Не написано про историю орошения в XX веке и про механизмы орошения	--Andreykor 15:43, 28 марта 2012 (UTC)
Статья неплохая, тема в принципе раскрыта; но мало ссылок на источники	--Brateevsky {talk} 16:52, 9 апреля 2012 (UTC)
Запросы источника	--DimaNižnik 19:58, 10 декабря 2016 (UTC)

Звёздный рейтинг

Наши проекты

TOP-9 на начало ноября 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	64,934	43,388	0	0	0	1,000	100.00	+0.09
2	ca	Català	1.1	46,690	36,934	0	0	2	998	99.89	+0.00
3	en	English	1.0	79,915	69,889	0	7	120	873	92.71	+0.11
4	zh	中文	3.7	63,270	37,103	0	0	186	813	89.66	+1.17
5	uk	Українська	1.3	38,506	32,917	0	0	356	644	80.22	+0.26
6	fr	Français	1.0	57,792	40,352	5	90	275	629	76.20	+0.23
7	de	Deutsch	1.0	52,314	37,748	10	78	317	595	74.46	+0.09
8	es	Español	1.1	53,150	36,114	4	81	327	588	74.23	+0.07
9	bg	Български	1.1	26,370	30,274	1	1	474	524	73.48	+0.32

TOP-9 на начало июля 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	64,283	42,709	0	0	1	999	99.94	+0.38
2	ca	Català	1.1	46,582	36,914	0	1	0	999	99.91	-0.09
3	en	English	1.0	78,471	69,415	0	7	126	867	92.38	+0.09
4	zh	中文	3.7	60,358	35,816	0	1	248	751	86.13	+0.24
5	uk	Українська	1.3	37,817	32,773	0	1	366	633	79.58	+0.15
6	fr	Français	1.0	56,752	39,686	6	92	287	615	75.28	+0.05
7	de	Deutsch	1.0	51,601	36,825	10	77	318	595	74.49	+0.27
8	es	Español	1.1	52,511	35,719	4	85	328	583	73.82	+0.11
9	bg	Български	1.1	26,159	30,233	2	1	478	519	73.16	-0.04

TOP-9 на начало июня 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ca	Català	1.1	46,602	36,902	0	0	0	1,000	100.00	+0.00
2	ru	Русский	1.4	64,087	42,781	3	1	1	995	99.56	-0.24
3	en	English	1.0	78,202	68,904	0	8	126	866	92.29	+0.10
4	zh	中文	3.7	59,825	35,627	0	0	254	746	85.89	+0.61
5	uk	Українська	1.3	37,718	32,732	0	2	367	631	79.43	+0.02
6	fr	Français	1.0	56,458	39,363	5	93	288	614	75.23	+0.20
7	de	Deutsch	1.0	51,377	36,423	11	77	321	591	74.22	+0.12
8	es	Español	1.1	52,270	35,713	4	85	330	581	73.71	+0.73
9	bg	Български	1.1	26,048	30,225	1	1	479	519	73.20	+0.17

TOP-9 на начало апреля 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ca	Català	1.1	46,509	36,837	0	0	0	1,000	100.00	+0.06
2	ru	Русский	1.4	63,657	42,634	0	0	0	1,000	100.00	+0.00
3	en	English	1.0	77,646	68,440	0	8	127	865	92.23	+0.22
4	zh	中文	3.7	58,430	35,201	0	0	284	716	84.22	+1.16
5	uk	Українська	1.3	37,492	32,706	2	0	369	629	79.30	-0.03
6	fr	Français	1.0	56,182	39,313	5	94	291	610	74.98	-0.11
7	de	Deutsch	1.0	51,004	36,331	9	79	324	588	74.08	+0.07
8	bg	Български	1.1	25,996	30,199	2	2	479	517	73.01	+0.04
9	es	Español	1.1	51,849	35,576	5	97	322	576	72.99	-0.10

TOP-9 на начало февраля 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	63,334	42,320	0	0	0	1,000	100.00	+0.00
2	ca	Català	1.1	46,339	36,719	0	0	1	999	99.94	+0.00
3	en	English	1.0	76,662	67,475	0	8	131	861	92.01	+0.14
4	zh	中文	3.7	57,523	34,965	0	1	311	688	82.63	+1.35
5	uk	Українська	1.3	37,203	32,645	0	1	373	626	79.19	+0.22
6	fr	Français	1.0	55,633	38,833	5	92	293	610	75.04	+0.00
7	de	Deutsch	1.0	50,520	36,264	9	81	321	589	74.07	-0.03
8	bg	Български	1.1	25,853	30,168	2	2	482	514	72.84	+0.52
9	es	Español	1.1	51,630	35,405	6	96	328	570	72.64	+0.11

TOP-9 на начало января 2014 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ru	Русский	1.4	63,032	42,075	0	0	0	1,000	100.00	+0.10
2	ca	Català	1.1	46,230	36,687	0	0	1	999	99.94	+0.10
3	en	English	1.0	76,243	67,163	0	9	132	859	91.87	+0.26
4	zh	中文	3.7	56,358	34,472	1	2	332	665	81.28	+1.18
5	uk	Українська	1.3	37,115	32,630	0	1	377	622	78.97	+0.31
6	fr	Français	1.0	55,346	38,602	5	92	293	610	75.04	+0.26
7	de	Deutsch	1.0	50,296	35,980	9	80	322	589	74.10	+0.26
8	es	Español	1.1	51,110	35,129	8	95	328	569	72.53	+0.03
9	bg	Български	1.1	25,418	30,063	2	2	491	504	72.32	+0.41

TOP-9 на начало сентября 2013 года:

№ Код Язык Вес Среднийразмер Медиана Нет Коротк. Средн. Длинн. Рейтинг Рост

1	ca	Català	1.1	45,779	36,641	0	0	0	1,000	100.00	+0.10
2	ru	Русский	1.4	61,823	41,574	0	0	0	1,000	100.00	+0.06
3	en	English	1.0	74,967	66,050	3	9	133	855	91.51	-0.25
4	uk	Українська	1.3	36,597	32,423	1	0	386	613	78.46	-0.05
5	zh	中文	3.7	53,846	32,282	1	0	428	571	76.12	+1.40
6	fr	Français	1.0	54,166	37,445	3	98	299	600	74.38	+0.16
7	de	Deutsch	1.0	49,553	35,671	11	83	331	575	73.13	-0.33
8	es	Español	1.1	50,482	33,929	7	97	338	558	71.90	-0.08
9	bg	Български	1.1	24,471	18,766	1	3	529	467	70.24	+0.90

Дополненные статьи и авторы

27 октября 2013‎ — Басня — Ace111
31 октября 2013‎ — Шуберт, Франц — Andreykor
31 октября 2013‎ — Конго (река) — Andreykor

ru.wikibedia.ru